另外一篇评价《Science》杂志上哈佛模型的文章,认为非常靠谱 ********************************************************** 作者: 古大师 来源:麦肯东 Science:新冠病毒感染未来悲观,深刻影响人类未来 2020-5-11 前些天,哈佛大学公共卫生学院发了一篇Science:
新冠病毒可能要陪伴人类很久,很久了……
根据论文中的描述,无论是否能研发出疫苗,新冠病毒都可能会陪伴人类到2025年。
那么,2025年以后人类能摆脱新冠病毒吗? 不,只是到时我们就已经习惯了这种隔离的生活方式了…… 具体来说,
1、被我们寄予厚望的疫苗,作用很可能会非常小! 因为人类感染者产生的抗体有效期可能只有40周(<300天),比疫苗的研发周期都要短!
如果疫苗不能起作用,那么新冠将会变成一个10-50倍致死率的流感,在全世界范围内反复爆发收割人头。
2、未来各国的策略,就是尽可能采用疏离措施,把感染率维持在一个较低的水平,以确保医疗体系不崩溃。
3、新冠会长期成为老年人类的头号杀手,而人类整体的医疗支出会大幅上升,预期寿命会降低。 现在看来更可能的情况是:以后的每一年,病毒都会呼啸而来,直到地老天荒.……
哈佛大学的仿真结果:每一年新冠病毒都会卷土重来
没想到人类还没攻克癌症、艾滋病,而大规模传染病就已经成为新的挑战…… 这下我终于理解为什么说21世纪是生命科学的世纪了!
闲言少叙,接下来就让我们看看这篇牛逼闪闪的Science里的到底说了点啥……
一、论文的思路和方法
文章题目“预测大流行后的新冠病毒会如何传播”(Projecting the transmission dynamics of SARS-CoV-2 through the postpandemic period)。 顾名思义,论文先假设各国能成功把这波疫情大流行控制住,然后预测未来病毒会如何传播。
注意,这篇文章不是预测最近几个月的感染人数,而是预测在未来很长一段时间(五年,甚至更长)疫情的爆发情况。
果然从视野上,哈佛大学的论文就跟外面那些妖艳的paper不一样! 但是,一个问题是,这篇文章是在3月初就已经发布了pre-print版本,所以数据主要是基于2月份中国、伊朗和韩国的数据,并没有统计之后一个月欧洲和美国那种惊心动魄的大爆发,那么他们是如何得出结论的呢?
因为他们找了其他4种冠状病毒作为新冠的“参考物”。
我来解释一下,这其实是非常普遍的思考方式,在日常生活中,我们就经常用这种方法来得到一些很难获得的数据。
具体到这篇论文,作者一共找了四个备选的β冠状病毒属作为参考物,它们分别是: ① SARS ② MERS ③ HCoV-OC43 ④ HCoV-HKU1
SARS的病死率9%,MERS的病死率可达36%,而HCoV-OC43和HCoV-HKU1 则只能引起普通的感冒症状,病死率极低。 用“病死率”和“传染性(R0)”两个指标来描述四种冠状病毒的位置: 如果看传染性,新冠与OC43和HKU1接近,但如果看病死率,则远远高于后两者 所以,最简单的方式就是通过OC43和HKU1的传播情况建立冠状病毒的模型,再模拟预测新冠病毒在未来的传播。 在初次爆发后,HKU1和OC43每年冬天都会卷土重来,“群体免疫”并没有什么luan用。
而同样的剧本,新冠也可能会上演
作者通过美国呼吸和肠病毒监测系统(NREVSS)拿到2014-2019年五年的抽样数据,以此确定HKU1和OC43分别在流感季中检测为阳性的比例。
接下来的工作就很简单了,只要通过美国门诊流感监测网络(ILINet)就可以获得ILI(也就是流感)每周就诊的数据,结合这个数据就可以知道HKU1和OC43的就诊数据。
再通过CDC(美国疾控和预防中心)的FluView Interactive网站,就可以获得美国整体的流感数据,同样也就按比例获得了OC43和HKU1的感染者数据! 接下来的工作就更简单了,相信每一个二年级的小学生都能做到:
只要构建一个“发生率模型”,把OC43和HKU1的传播数据代入模型,确定模型的参数,就可以预测新冠在未来的传播情况!
这个“发生率模型”需要考虑3个参数:
1、季节性传播参数 HCoV-OC43和HCoV-HKU1主要在温带地区冬季爆发,说明冬季的气候和人类生活习惯可能有助于冠状病毒的传播。 也就是说,不同季节新冠的传播能力可能是不同的。
2、免疫力持续的时间 HCoV-OC43和HCoV-HKU1免疫力只能持续大约40周,而SARS感染后获得的免疫力可以相对更长,但由于缺少具体的数据,所以无法准确判断。 免疫力持续的时间是一个非常关键的指标! 事实上此前一些研究也表明,新冠病毒在体内更像流感,而不是SARS:NEJM:新冠病毒在体内模式,反而像流感,不同于SARS
3、交叉免疫程度 很神奇的一点是,不同的β冠状病毒可以诱导相互之间的免疫反应。 当初祸害人类几千年的天花,就是死在了牛痘这个猪队友的交叉免疫之下! “交叉免疫”:因为得了其它冠状病毒(温和的),结果连厉害的冠状病毒也免疫了! 调整以上三个模型参数,再通过计算机模拟,就可以得到OC43和HKU1两种病毒的传播数据,结果发现与实际的传播情况拟合得非常好! 所以,这个模型是非常靠谱的! 接下来要做的事情,想必各位已经非常清楚了……,就是把发生率模型应用在新冠肺炎的预测中。
二、论文的主要结论
1、新冠病毒可以在一年中的任何时候扩散! 在论文的设置的所有季节,SARS-CoV-2 都!爆!发!了! 但前文说过,不同季节还是略有差异,比如秋冬季相交时的疫情会非常猛烈,而冬春季相交时的疫情则爆发和缓,但持续时间比较长。 新冠在秋冬之交的爆发会更猛烈一些 具体的不同时间尺度的模拟结果如下表: 新冠病毒在四季均有可能爆发,但烈度会有所不同
2、如果感染者痊愈后不能获得长久的免疫力,那么新冠肺炎将会和其他的人类冠状病毒一样,在人类社会中一直存在,不停爆发。 抗体的有效期将直接影响未来新冠病毒爆发的频次
1)如果抗体的免疫力只能维持40周,那么新冠必然每年都会爆发一次(这种情况下的群体免疫策略就是一个彻底的笑话)。
2)如果抗体的免疫力能维持104周(两年),那么新冠会2、3年出现一次大爆发,但每年也仍然会有小规模的疫情出现。
以上两种情况,意味着抗体起作用的周期与疫苗研发的周期相当,或甚至远远短于疫苗研发周期,那么疫苗研发就必须成为一个常态性工作,永远持续下去,尽可能地帮人群建立抗体。 未来每个人每年都要至少注射一次疫苗!就象流感疫苗一样,一方面每天都要注射一次(因为起作用时间短),另一方面,每年流感病毒都略有变异。 也许是这篇论文的结论太丧,于是四位作者又给了一个最乐观的情况下的预测:
3)如果人类获得的免疫力是永久性的,新冠的感染率会大幅下降,病毒会消失五年或更长时间。 最乐观的预测:疫情从明年开始彻底消失,就象SARS一样,一阵风飘过地球! 但是,众所周知的是,RNA病毒最大的特点就是,突变率非常高,因为复制RNA时很容易出错,这也造成了RNA病毒对环境极强的适应性。SARS彻底没有了,一方面与防控有关,另一方面与抗体持久性有关。新冠病毒更象HCoV-OC43和HCoV-HKU1,只能维持大约40周的免疫力,很难象SARS一样,人类一旦感染后,获得相对持久的免疫。 所以,这种最乐观的情况,基本上是不太可能发生的……,实际上以前也有报道:夏天来了,新冠病毒会像SARS一样消失吗? 三、人类的“幸运”已经结束了 潘多拉的盒子打开,疫情在全世界蔓延,不是一年、两年,而是五年、十年,甚至可能一直持续下去, 这意味着:
彼此间的隔离将成为常态,人与人之间日常的交际会显著减少,甚至传承了成百上千年的很多风俗习惯也会彻底消失。
未来的服务业将受到极大的抑制,人们会压缩非必须的服务业需求,除了医疗、教育等必须的服务需求外,其他都将尽可能地抑制。
例如对于人类的旅游业、餐饮业、院线、商业地产等等以及其他一切服务业相关行业可能都是重大的打击,可能彻底改变旅游业的业务逻辑。
又比如NBA的收入结构可能要发生根本的变化,人类体育运动最吸金的产业,可能会变成网络游戏。 这类观众密集的体育赛事可能永远都不会出现了 在线教育、在线医疗、远程服务、VR、AR产业将迎来一波大发展,行业估值的逻辑已经完全改变了……
也许10年后,我们回忆2019年时,羡慕当时能自由自在的逛公园,聚会!因为,这一切在未来都是奢侈品!
所以,时代真的变了,你准备好了吗?
原始出处: Kissler SM, Tedijanto C, Goldstein E, Grad YH, Lipsitch M. Projecting the transmission dynamics of SARS-CoV-2 through the postpandemic period.Science . 2020 Apr 14:eabb5793. doi: 10.1126/science.abb5793. 作者: 古大师 来源:麦肯东
science上的英文原版在这里:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7164482/
今天又在网上看到这篇文章。
这篇文章很重要,基本上从科学角度宣判了美国经济和股市的死刑。
概括起来就一句话:美国的疫情无法控制。会成为流感一样的病毒,一直反复。疫苗跟不上变异的速度。
当然任何结论都是有条件的:这文章在满足一个条件下不会发生,就是全国行动一致,集体隔离lockdown到接近清零程度,或者全民常年集体戴口罩。但这个美国现在做不到。也许几年后会被迫做到。